跟蹤資金流向時，必須把資金使用事項同資金流具體地結合起來進行分析。一是從資金使用事項的內(nèi)涵與背景來分析，判斷資金流是否正常；二是套取資金時，一般應將資金從正常渠道分流出來，使之在形式上消失，再另行使用；三是從不正常的資金流中反查資金使用事項與背景，追蹤資金流向的終端，從而發(fā)現(xiàn)問題。
　　查詢銀行賬號是跟蹤資金流向最有效、最普遍采用的方法。建設項目一般投資額大，涉及的單位多，資金流向比較廣，審計要每筆資金都查詢銀行賬號沒必要，也力所難及。在實踐中，這就需要工程審計與財務審計相互結合，通過延伸審計，發(fā)現(xiàn)工程結算方面問題多、資金流向異常，以確定對哪些單位銀行賬號進行查詢。
　　三、成本分析是我們必用的方法。
　　在具體的審計實踐中，我們主要從以下四個方面進行對比分析。
　　一是與概算對比分析：對已完工項目將工程價款結算相關數(shù)據(jù)與批準的設計概算進行對比分析。主要是對比二者的價差和量差，檢查概算執(zhí)行情況，核實概算編制的準確性與完整性及建設項目結余資金的真實性。對超概算比較嚴重的單項工程，要予以重點關注，分析查找超概算的原因。
　　二是將施工單位項目部的直接成本（指扣除上交公司管理費后）和利潤這兩個指標與行業(yè)平均指標進行對比分析，若存在成本過高或超額利潤，就要關注工程是否存在偷工減料、高估冒算、虛假成本套取資金及工程質量等方面的問題。
　　三是將材料耗用量與工程用量進行比較， 分多個層次進行工料對比分析。
　　首先將合同工程量工料分析結果與財務統(tǒng)計量進行對比分析，如合同工程量工料分析量大于（指偏差較大已偏離正常范圍）財務統(tǒng)計量可初步判斷合同工程量偏大，下一步對工程量要重點核實；反之則要重點關注工程變更。
　　其次將送審結算工程量工料分析結果與財務反應工程量進行對比、分析，據(jù)此確定下一步工作重點，如工料分析量大于財務反應工程量可初步判定工程量有虛報冒領或偷工減料等問題，反之則可初步判定有虛列成本現(xiàn)象，此時重點要放在有無利用假發(fā)票虛列成本轉移資金上。
　　最后要根據(jù)施工、竣工圖紙并結合現(xiàn)場實測核實工程量，在此基礎上再進行工料分析，如工料分析量大于財務統(tǒng)計量，首先要對工程量計算進行復核，審查有無漏算和未關注到的地方，再要關注有無偷工減料現(xiàn)象。反之則要與財務一起對發(fā)票一一核實弄清其真假，并緊抓資金走向看資金有無回流或流向個人現(xiàn)象，建、施雙方有無通過工程結算套取資金等，對資金流向一定要查到底，弄清其最終目的。