為加強(qiáng)跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅的征收管理，根據(jù)《財(cái)政部國家稅務(wù)總局中國人民銀行關(guān)于印發(fā)〈跨省市總分機(jī)構(gòu)企業(yè)所得稅分配及預(yù)算管理辦法〉的通知》（財(cái)預(yù)[2012]40號(hào)）（以下簡稱40號(hào)文件）等的精神，稅務(wù)總局在充分調(diào)查研究的基礎(chǔ)上，對(duì)《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)的通知》（國稅發(fā)[2008]28號(hào)）（以下簡稱28號(hào)文件）進(jìn)行了修訂和完善，制定了《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理辦法》（以下簡稱《辦法》），并發(fā)布公告?，F(xiàn)將《辦法》的主要內(nèi)容解讀如下：

　　一、如何把握40號(hào)文件的主要政策變化點(diǎn)？

　　與《財(cái)政部國家稅務(wù)總局中國人民銀行關(guān)于印發(fā)的通知》（財(cái)預(yù)[2008]10號(hào))相比，40號(hào)文件的政策變化點(diǎn)主要體現(xiàn)在：（1）明確總分機(jī)構(gòu)參與匯算清繳稅款分配，即匯算清繳應(yīng)補(bǔ)應(yīng)退稅款按照預(yù)繳分配比例分配給總分機(jī)構(gòu)，由總分機(jī)構(gòu)就地辦理稅款繳庫或退庫，改變了匯繳補(bǔ)退稅均通過中央國庫辦理、總分機(jī)構(gòu)都不參與就地分享的做法。（2）明確了總分機(jī)構(gòu)查補(bǔ)稅款就地入庫問題，突破了就地監(jiān)管的政策瓶頸。（3）不適用范圍的調(diào)整，企業(yè)所得稅全額歸屬中央收入的企業(yè)由14家調(diào)整為15家。（4）分支機(jī)構(gòu)“三因素”所屬區(qū)間的調(diào)整，統(tǒng)一確定為上年度，不再區(qū)分上上年度和上年度。（5）明確當(dāng)年撤銷的分支機(jī)構(gòu)自辦理注銷稅務(wù)登記之日起不參與分?jǐn)?，不再從第二年起才不參與分?jǐn)偂＃?）采用會(huì)計(jì)準(zhǔn)則的表述和口徑，將“三因素”中的“經(jīng)營收入”改為“營業(yè)收入”，“職工工資”調(diào)整為“職工薪酬”，對(duì)“資產(chǎn)總額”的解釋不再排除無形資產(chǎn)。（7）增設(shè)和修訂了若干預(yù)算科目。這些政策變化點(diǎn)，都已完整地體現(xiàn)在《辦法》相關(guān)條款中。

　　二、現(xiàn)行跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征管的文件主要有哪些？《辦法》與這些文件的關(guān)系是什么？

　　現(xiàn)行跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征管方面的文件，主要包括28號(hào)文件、國稅函[2008]747號(hào)、國稅函[2008]958號(hào)、國稅函[2009]221號(hào)、國稅發(fā)[2009]79號(hào)、國稅發(fā)[2008]120號(hào)、稅務(wù)總局公告2011年第25號(hào)、稅務(wù)總局公告2012年第12號(hào)等文件，其中，28號(hào)文件是核心規(guī)定，其他文件是重要補(bǔ)充。

　　《辦法》以28號(hào)文件為母版進(jìn)行了增減修訂，增加了二級(jí)分支機(jī)構(gòu)判定（第四條、第二十三條、第二十四條）、不同稅率地區(qū)計(jì)算（第十八條）和計(jì)算差錯(cuò)糾正（第二十條）（來自國稅函[2009]221號(hào)），新設(shè)分支機(jī)構(gòu)判定（第十六條）（來自國稅函[2008]958號(hào)），分支機(jī)構(gòu)匯繳報(bào)送資料（第十一條）（來自國稅函[2009]221號(hào)、國稅發(fā)[2009]79號(hào)），資產(chǎn)損失管理（第二十五條）（來自稅務(wù)總局公告2011年第25號(hào)），稅收優(yōu)惠管理（第二十六條）（來自稅務(wù)總局公告2012年第12號(hào)），不得核定征收（第三十一條）（來自國稅函[2008]747號(hào)），征管范圍劃分（第三十條）（來自國稅發(fā)[2008]120號(hào)）等很多現(xiàn)行有效規(guī)定，并進(jìn)行了更為準(zhǔn)確和精煉地表述。