某建筑企業(yè)（以下簡稱總公司）設(shè)有一個二級機(jī)構(gòu)甲分公司，2012年在異地設(shè)有直接管理的項目部A和B，甲分公司在異地設(shè)有管理的項目部C.A項目部不獨立核算，采用向總公司報賬制管理方式，B和C項目部的經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額與總公司分開核算。2012年一季度總公司共取得利潤2000萬元，其中甲分公司取得利潤1000萬元，總公司直接管理的項目部A取得利潤 500萬元，項目部B取得利潤400萬元。該建筑企業(yè)是實行查賬征收，按照實際利潤額預(yù)繳企業(yè)所得稅的居民納稅人，假設(shè)以前年度無可彌補(bǔ)虧損。

    二級分支機(jī)構(gòu)的判定

    《跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法》（國稅發(fā)[2008]28號）規(guī)定，總機(jī)構(gòu)和具有主體生產(chǎn)經(jīng)營職能的二級分支機(jī)構(gòu)，就地分期預(yù)繳企業(yè)所得稅?？倷C(jī)構(gòu)設(shè)立具有獨立生產(chǎn)經(jīng)營職能部門，且具有獨立生產(chǎn)經(jīng)營職能部門的經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額與管理職能部門分開核算的，可將具有獨立生產(chǎn)經(jīng)營職能的部門視同一個分支機(jī)構(gòu)，就地預(yù)繳企業(yè)所得稅?！秶叶悇?wù)總局關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理若干問題的通知》（國稅函[2009]221號）關(guān)于二級分支機(jī)構(gòu)的判定問題進(jìn)一步明確，二級分支機(jī)構(gòu)是指總機(jī)構(gòu)對其財務(wù)、業(yè)務(wù)、人員等直接進(jìn)行統(tǒng)一核算和管理的領(lǐng)取非法人營業(yè)執(zhí)照的分支機(jī)構(gòu)。因此，甲分公司二級機(jī)構(gòu)就地分期預(yù)繳企業(yè)所得稅；B項目部雖然不是二級分支機(jī)構(gòu)，但是作為總公司設(shè)立具有獨立生產(chǎn)經(jīng)營職能部門，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額與總公司分開核算，B項目部視同一個分支機(jī)構(gòu)，也可以就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。

    二級分支機(jī)構(gòu)及其下屬機(jī)構(gòu)均由二級分支機(jī)構(gòu)集中就地預(yù)繳企業(yè)所得稅；三級及以下分支機(jī)構(gòu)不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，其經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額統(tǒng)一計入二級分支機(jī)構(gòu)。C項目部的經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額與總公司雖然可以分開核算。但C項目部是二級分支機(jī)構(gòu)下屬機(jī)構(gòu)，不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。由二級分支機(jī)構(gòu)甲分公司集中就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。具有獨立生產(chǎn)經(jīng)營職能部門與管理職能部門的經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額不能分開核算的，具有獨立生產(chǎn)經(jīng)營職能的部門不得視同一個分支機(jī)構(gòu)，不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。A項目部采用向總公司報賬制管理方式，不獨立核算也不就地預(yù)繳企業(yè)所得稅。

    各機(jī)構(gòu)應(yīng)納稅款的計算與填報

    《國家稅務(wù)總局關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營建筑企業(yè)所得稅征收管理問題的通知》（國稅函[2010]156號）規(guī)定，建筑企業(yè)總機(jī)構(gòu)直接管理的跨地區(qū)設(shè)立的項目部，應(yīng)按項目實際經(jīng)營收入的0.2%按月或按季由總機(jī)構(gòu)向項目所在地預(yù)繳企業(yè)所得稅，并由項目部向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)預(yù)繳。在異地設(shè)有直接管理的項目部A和B，但B項目視同一個分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳企業(yè)所得稅，因此不適用上述規(guī)定。A項目部就地預(yù)分企業(yè)所得稅500×0.2%＝1（萬元）。填在《企業(yè)所得稅月（季）度預(yù)繳納稅申報表（A類）》“特定業(yè)務(wù)預(yù)繳（征）所得稅額”欄。