（二）對(duì)開(kāi)發(fā)土地和新建房及配套設(shè)施的成本（簡(jiǎn)稱開(kāi)發(fā)成本）中的土地征用及拆遷補(bǔ)償費(fèi)、前期工程費(fèi)、建筑安裝工程費(fèi)、基礎(chǔ)設(shè)施費(fèi)、公共配套設(shè)施費(fèi)、開(kāi)發(fā)間接費(fèi)用等支出。
    房地產(chǎn)開(kāi)發(fā)成本中公共配套設(shè)施費(fèi)的扣除范圍確認(rèn)，以房地產(chǎn)開(kāi)發(fā)中必須建造、但不能有償轉(zhuǎn)讓的非營(yíng)利性的社會(huì)公共事業(yè)設(shè)施所發(fā)生的支出確定。非營(yíng)利性的社會(huì)公共事業(yè)設(shè)施主要是指：物業(yè)辦公場(chǎng)所、變電站、熱力站、水廠、居委會(huì)、派出所、托兒所、幼兒園、學(xué)校、醫(yī)院、郵電通訊、自行車(chē)棚、公共廁所等。由于各開(kāi)發(fā)項(xiàng)目配套設(shè)施情況不同，必須先確定允許扣除的配套設(shè)施面積后再計(jì)算分?jǐn)偂?br />     對(duì)于成片開(kāi)發(fā)分期清算項(xiàng)目的公共配套設(shè)施費(fèi)用，在先期清算時(shí)應(yīng)按實(shí)際發(fā)生的費(fèi)用進(jìn)行分?jǐn)偂?br />     對(duì)于后期清算時(shí)實(shí)際支付的公共配套設(shè)施費(fèi)用分?jǐn)偙壤笥谇捌诘慕痤~時(shí)，允許在整體項(xiàng)目全部清算時(shí)，按照整體項(xiàng)目重新進(jìn)行調(diào)整分?jǐn)偂?br />     （三）對(duì)開(kāi)發(fā)土地和新建房及配套設(shè)施的費(fèi)用（銷(xiāo)售費(fèi)用、管理費(fèi)用、財(cái)務(wù)費(fèi)用）扣除的確定，對(duì)財(cái)務(wù)費(fèi)用中的利息支出凡能夠按清算項(xiàng)目計(jì)算分?jǐn)偛⑻峁┙鹑跈C(jī)構(gòu)證明的，允許據(jù)實(shí)扣除，但最高不能超過(guò)按商業(yè)銀行同類同期貸款利率計(jì)算的金額。其他房地產(chǎn)開(kāi)發(fā)費(fèi)用，按取得土地使用權(quán)所支付的金額和房地產(chǎn)開(kāi)發(fā)成本計(jì)算的金額之和的5％計(jì)算扣除。
    對(duì)財(cái)務(wù)費(fèi)用中的利息支出凡不能按清算項(xiàng)目計(jì)算分?jǐn)偦蛱峁┙鹑跈C(jī)構(gòu)利息證明的，利息不能單獨(dú)扣除，房地產(chǎn)開(kāi)發(fā)費(fèi)用采用按率扣除的方法，以取得土地使用權(quán)所支付的金額和房地產(chǎn)開(kāi)發(fā)成本計(jì)算的金額之和的10％進(jìn)行計(jì)算扣除。
    （四）與轉(zhuǎn)讓房地產(chǎn)有關(guān)的稅金。
    （五）財(cái)政部規(guī)定的其他扣除項(xiàng)目。
    第十八條 對(duì)開(kāi)發(fā)土地和新建房及配套設(shè)施的成本（簡(jiǎn)稱開(kāi)發(fā)成本）中的前期工程費(fèi)、建筑安裝工程費(fèi)、基礎(chǔ)設(shè)施費(fèi)、開(kāi)發(fā)間接費(fèi)用等，按有效憑證金額據(jù)實(shí)扣除。對(duì)納稅人進(jìn)行土地增值稅清算時(shí)，有下列情況之一的，應(yīng)按核定辦法扣除：
    （一）無(wú)法按清算要求提供開(kāi)發(fā)成本核算資料的；
    （二）提供的開(kāi)發(fā)成本資料不實(shí)的；
    （三）發(fā)現(xiàn)《鑒證報(bào)告》內(nèi)容有問(wèn)題的；
    （四）清算項(xiàng)目中的前期工程費(fèi)、建筑安裝工程費(fèi)、基礎(chǔ)設(shè)施費(fèi)、開(kāi)發(fā)間接費(fèi)用的每平方米建安成本扣除額，明顯高于北京市地方稅務(wù)局制定的《分類房產(chǎn)單位面積建安造價(jià)表》中公布的每平方米工程造價(jià)金額，又無(wú)正當(dāng)理由的。
    第十九條 主管稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)四項(xiàng)成本核定扣除的，應(yīng)向納稅人開(kāi)具《土地增值稅四項(xiàng)成本核定通知書(shū)》（附件11）。
    第二十條 地方稅務(wù)機(jī)關(guān)根據(jù)建設(shè)部門(mén)定期公布的建安指導(dǎo)價(jià)格，結(jié)合商品房用途、結(jié)構(gòu)等因素制定《分類房產(chǎn)單位面積建安造價(jià)表》，作為第十八條所列四項(xiàng)開(kāi)發(fā)成本核定的依據(jù)。《分類房產(chǎn)單位面積建安造價(jià)表》及核算方法，由市地方稅務(wù)局另行制定下發(fā)。
    第五章 清算管理
    第二十一條 各區(qū)縣地方稅務(wù)局要做好土地增值稅的清算管理工作，認(rèn)真查驗(yàn)和審核清算企業(yè)報(bào)送的《鑒證報(bào)告》內(nèi)容及相關(guān)資料，在審查清算項(xiàng)目過(guò)程中因鑒證事項(xiàng)或其他問(wèn)題需要納稅人進(jìn)一步補(bǔ)充與清算項(xiàng)目相關(guān)的證明資料時(shí)，決定暫停清算，應(yīng)向納稅人開(kāi)具《土地增值稅清算中止核準(zhǔn)通知書(shū)》（附件7），待納稅人重新補(bǔ)充證明資料后，再辦理稅款清算手續(xù)。
    第二十二條 主管地方稅務(wù)機(jī)關(guān)經(jīng)過(guò)清算審核后，決定對(duì)納稅人申請(qǐng)的清稅項(xiàng)目不予核準(zhǔn)的，應(yīng)向納稅人開(kāi)具《土地增值稅清算終止核準(zhǔn)通知書(shū)》（見(jiàn)附件8）。
    第二十三條 主管地方稅務(wù)機(jī)關(guān)經(jīng)過(guò)清算審核后，決定對(duì)納稅人申請(qǐng)的清稅項(xiàng)目予以核準(zhǔn)的，應(yīng)向納稅人開(kāi)具《土地增值稅清算核準(zhǔn)通知書(shū)》（見(jiàn)附件10）。
    第二十四條 主管地方稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)加強(qiáng)對(duì)清算項(xiàng)目的監(jiān)督檢查，按照本地區(qū)工作的實(shí)際情況，稽查部門(mén)可對(duì)已清算項(xiàng)目進(jìn)行抽查檢查。在清算中有下列情況的之一的，審核部門(mén)應(yīng)在清算完成后將項(xiàng)目情況提交稽查部門(mén)，作為重點(diǎn)檢查對(duì)象：
    （一）納稅人辦理清稅時(shí)，發(fā)生《鑒證報(bào)告》內(nèi)容不規(guī)范，退回重報(bào)的；
    （二）納稅人辦理清稅后，根據(jù)《鑒證報(bào)告》發(fā)生退稅的。