另外，除另有規(guī)定(企業(yè)合并、分立適用特殊性稅務(wù)處理時(shí)虧損的繼承彌補(bǔ))外，境內(nèi)企業(yè)之間、境內(nèi)與境外企業(yè)之間、境外企業(yè)之間的盈虧不得互抵。但同一國(guó)家分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧允許互抵。企業(yè)在匯總繳納企業(yè)所得稅時(shí)，境內(nèi)分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧允許互抵，境外同一國(guó)家(地區(qū))分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧允許互抵，境外不同國(guó)家(地區(qū))分支機(jī)構(gòu)之間的盈虧也不得互抵。

　　資產(chǎn)損失追補(bǔ)確認(rèn)出現(xiàn)虧損的彌補(bǔ)
　　國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于企業(yè)資產(chǎn)損失所得稅稅前扣除管理辦法》(國(guó)家稅務(wù)總局公告2011年第25號(hào))規(guī)定，企業(yè)因以前年度實(shí)際資產(chǎn)損失未在稅前扣除而多繳的企業(yè)所得稅稅款，可在追補(bǔ)確認(rèn)年度企業(yè)所得稅應(yīng)納稅款中予以抵扣，不足抵扣的，向以后年度遞延抵扣。企業(yè)實(shí)際資產(chǎn)損失發(fā)生年度扣除追補(bǔ)確認(rèn)的損失后出現(xiàn)虧損的，應(yīng)先調(diào)整資產(chǎn)損失發(fā)生年度的虧損額，再按彌補(bǔ)虧損的原則，計(jì)算以后年度多繳的企業(yè)所得稅稅款，并按前款辦法進(jìn)行稅務(wù)處理。
　　例如，某企業(yè)2010年度發(fā)生資產(chǎn)損失100萬(wàn)元，當(dāng)年未能扣除。2010、2011年度匯算清繳納稅調(diào)整后所得分別為80、60萬(wàn)元，2010年應(yīng)納稅額=80×25%=20(萬(wàn)元)，2011年應(yīng)納稅額=60×25%=15(萬(wàn)元)。2012年3月，企業(yè)向稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)追補(bǔ)扣除該資產(chǎn)損失。為此，2010年度納稅調(diào)整后所得=80-100=-20(萬(wàn)元)，無(wú)須納稅;2011年度應(yīng)納稅額=(60-20)×25%=10(萬(wàn)元)。則該企業(yè)2010、2011年分別多繳企業(yè)所得稅20萬(wàn)元、5萬(wàn)元。

　　查增應(yīng)納稅所得額可彌補(bǔ)以前年度虧損
　　國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于查增應(yīng)納稅所得額彌補(bǔ)以前年度虧損處理問(wèn)題的公告》(國(guó)家稅務(wù)總局公告2010年第20號(hào))規(guī)定，稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)企業(yè)以前年度納稅情況進(jìn)行檢查時(shí)調(diào)增的應(yīng)納稅所得額，凡企業(yè)以前年度發(fā)生虧損、且該虧損屬于企業(yè)所得稅法規(guī)定允許彌補(bǔ)的，應(yīng)允許調(diào)增的應(yīng)納稅所得額彌補(bǔ)該虧損。彌補(bǔ)該虧損后仍有余額的，按照企業(yè)所得稅法規(guī)定計(jì)算繳納企業(yè)所得稅。
　　例如，某企業(yè)經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)檢查后需調(diào)增2011年應(yīng)納稅所得額100萬(wàn)元，該企業(yè)以前年度存在虧損。假設(shè)企業(yè)2010年度自行申報(bào)應(yīng)納稅所得額50萬(wàn)，彌補(bǔ)以前年度虧損50萬(wàn)元，累計(jì)結(jié)轉(zhuǎn)可在以后年度彌補(bǔ)的虧損額50萬(wàn)元。則調(diào)增的所得額100萬(wàn)元可用于彌補(bǔ)以前年度虧損50萬(wàn)元，盈余的50萬(wàn)元應(yīng)按適用稅率補(bǔ)繳企業(yè)所得稅。

　　被投資企業(yè)的經(jīng)營(yíng)虧損不得在投資方彌補(bǔ)
　　國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于企業(yè)所得稅若干問(wèn)題的公告》(國(guó)家稅務(wù)總局公告2011年第34號(hào))第五條第二款規(guī)定，被投資企業(yè)發(fā)生的經(jīng)營(yíng)虧損，由被投資企業(yè)按規(guī)定結(jié)轉(zhuǎn)彌補(bǔ);投資企業(yè)不得調(diào)整減低其投資成本，也不得將其確認(rèn)為投資損失。