1）證券公司預(yù)扣預(yù)繳應(yīng)納稅所得額=限售股轉(zhuǎn)讓收入-（限售股原值+合理稅費(fèi)）=股改限售股復(fù)牌日收盤價×減持股數(shù)-股改限售股復(fù)牌日收盤價×減持股數(shù)×15%=15元/股×100萬股-15元/股×100萬股×15%=1275（萬元），應(yīng)納稅額=應(yīng)納稅所得額×稅率=1275×20%=255（萬元）。

    2）申報清算應(yīng)納稅款如果老李能提供完整、真實的限售股原值憑證，應(yīng)納稅所得額=限售股轉(zhuǎn)讓收入-（限售股原值+合理稅費(fèi)）=1000-（200+2）=798（萬元），應(yīng)納稅額=應(yīng)納稅所得額×稅率=798×20%=159.6（萬元）。應(yīng)退還的稅款=已扣繳稅額-應(yīng)納稅額=255-159.6=95.4（萬元）。而案例中老李未能提供完整、真實的限售股原值憑證，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)按限售股轉(zhuǎn)讓收入的15%核定限售股原值及合理稅費(fèi)。應(yīng)納稅所得額=限售股轉(zhuǎn)讓收入-（限售股原值+合理稅費(fèi)）=限售股轉(zhuǎn)讓收入-限售股轉(zhuǎn)讓收入×15%=1000-1000×15%=850（萬元），應(yīng)納稅額=應(yīng)納稅所得額×稅率=850×20%=170（萬元）。應(yīng)退還的稅款=已扣繳稅額-應(yīng)納稅額=255-170=85（萬元），多繳稅95.4-85=10.4萬元。

    方法二：證券機(jī)構(gòu)技術(shù)和制度準(zhǔn)備完成后新上市公司的限售股，按照證券機(jī)構(gòu)事先植入結(jié)算系統(tǒng)的限售股成本原值和發(fā)生的合理稅費(fèi)，以實際轉(zhuǎn)讓收入減去原值和合理稅費(fèi)后的余額按20%稅率，計算并直接扣繳個人所得稅額。納稅人同時持有限售股及該股流通股的，其股票轉(zhuǎn)讓所得，按照限售股優(yōu)先原則，即：轉(zhuǎn)讓股票視同為先轉(zhuǎn)讓限售股，按規(guī)定計算繳納個人所得稅。

    例2、證券機(jī)構(gòu)技術(shù)和制度準(zhǔn)備完成后，老張持有某股票的100萬股限售股和30萬股流通股，限售股原始取得成本為462萬元（結(jié)算系統(tǒng)取得成本）；流通股取得成本為201萬元。2009年12月，老張持有的限售股全部解禁可上市流通。2010年1月11日，老張將所持有的限售股和流通股賣出120萬股，合計取得轉(zhuǎn)讓收入1200萬元，發(fā)生合理稅費(fèi)1.2萬元。按照財稅[2009]167號文規(guī)定，老張轉(zhuǎn)讓股票視同為先轉(zhuǎn)讓限售股，證券機(jī)構(gòu)按規(guī)定直接計算扣繳其個人所得稅。

    老張賣出120萬股股票，應(yīng)視同為轉(zhuǎn)讓限售股100萬股和20萬股流通股，那限售股轉(zhuǎn)讓收入=轉(zhuǎn)讓總收入×限售股轉(zhuǎn)讓股數(shù)÷（限售股+流通股轉(zhuǎn)讓股數(shù)）=1200×100÷120=1000（萬元），同理，限售股轉(zhuǎn)讓成本應(yīng)分?jǐn)偤侠矶愘M(fèi)=1.2×100÷120=1（萬元）。應(yīng)納稅所得額=限售股轉(zhuǎn)讓收入-（限售股原值+合理稅費(fèi)）=限售股實際轉(zhuǎn)讓收入-（限售股成本原值+轉(zhuǎn)讓合理稅費(fèi)）=1000-（462+1）=537（萬元），應(yīng)納稅額=應(yīng)納稅所得額×稅率=537×20%=107.4（萬元）。