財稅[2009]27號的發(fā)布日期和執(zhí)行起始日不同，要求從2008 年1月1日起執(zhí)行，而該文件的發(fā)文日期是6月2日， 已過匯算清繳期，納稅人無法在匯算清繳時執(zhí)行，只能在匯算清繳期過后再按規(guī)定重新計算2008年度稅款。根據(jù)《中華人民共和國稅收征收管理法》第五十二條 規(guī)定，因稅務(wù)機關(guān)的責任，致使納稅人、扣繳義務(wù)人未繳或者少繳稅款的，稅務(wù)機關(guān)在三年內(nèi)可以要求納稅人、扣繳義務(wù)人補繳稅款，但是不得加收滯納金，因此， 應該可以理解為不要加收滯納金。如果納稅人因財稅[2009]27號文件規(guī)定而涉及多繳稅款的，納稅人可以按規(guī)定向稅務(wù)機關(guān)要求退還多繳的稅款并加算銀行 同期存款利息；如果納稅人因財稅[2009]27號文件規(guī)定而涉及補稅的，稅務(wù)機關(guān)可以要求納稅人補繳稅款，但不得加收滯納金。

    【計稅基數(shù)】

     補充養(yǎng)老保險、醫(yī)療保險以職工工資總額為基數(shù)。工資、薪金總額，是指企業(yè)按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)工資、薪金及職工福利費扣除問題的通知》(國稅函 [2009]3號)第一條規(guī)定實際發(fā)放的工資、薪金總和，不包括企業(yè)的職工福利費、職工教育經(jīng)費、工會經(jīng)費以及養(yǎng)老保險費、醫(yī)療保險費、失業(yè)保險費、工傷 保險費、生育保險費等社會保險費和住房公積金。屬于國有性質(zhì)的企業(yè)．其工資、薪金，不得超過政府有關(guān)部門給予的限定數(shù)額；超過部分，不得計入企業(yè)工資、薪 金總額，也不得在計算企業(yè)應納稅所得額時扣除。

     第一條規(guī)定，所謂合理工資、薪金，是指企業(yè)按照股東大會、董事會、薪酬委員會或相關(guān)管理機構(gòu)制定的工資、薪金制度規(guī)定，實際發(fā)放給員工的工資、薪金。因 此，財稅[2009]27號文件中的工資總額，應該等同于國稅函[2009]3號文件中的工資、薪金總額，其計算口徑應該和計算職工福利費支出、職工教育 經(jīng)費支出、工會經(jīng)費支出所用的工資、薪金總額一樣，都是按企業(yè)實際發(fā)放的工資、薪金總額。 《國家稅務(wù)總局關(guān)于(中華人民共和國企業(yè)所得稅年度納稅申報表>的補充通知》(國稅函[2008 3 1081號)的“附表三《納稅調(diào)整項目明細表》填報說明”規(guī)定，  “工資薪金支出”：第1列“賬載金額”，納稅人按照國家統(tǒng)一會計制度計入成本費用的職工工資、獎金、津貼和補貼填報。第2列“稅收金額”，納稅人按照稅收 規(guī)定允許稅前扣除的工資、薪金填報。如第1列≥第2列，第1列減去第2列的差額填入第3列“調(diào)增金額”；如第1列<第2列。第2列減去第1列的差額 填人第4列“調(diào)增金額”。