《農(nóng)業(yè)產(chǎn)品征稅范圍注釋》（財稅字〔1995〕52號）規(guī)定，購進農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的下腳料等，可以按13%的稅率抵扣增值稅進項稅額。秸稈和畜禽糞便，都屬于農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的下腳料。
 

　　增值稅暫行條例第二條規(guī)定，銷售沼氣按13%增值稅稅率繳納增值稅。
 

　　《財政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整完善資源綜合利用產(chǎn)品及勞務(wù)增值稅政策的通知》（財稅〔2011〕115號）第三條第（二）項規(guī)定：“以餐廚垃圾、畜禽糞便、稻殼、花生殼、玉米芯、油茶殼、棉籽殼、三剩物、次小薪材、含油污水、有機廢水、污水處理后產(chǎn)生的污泥、油田采油過程中產(chǎn)生的油污泥（浮渣），包括利用上述資源發(fā)酵產(chǎn)生的沼氣為原料生產(chǎn)的電力、熱力、燃料。生產(chǎn)原料中上述資源的比重不低于80%”，可以享增值稅即征即退100%的優(yōu)惠。
 

　　值得注意的是，此項條款采取原料列舉法，秸稈并沒有列入其中。因此，沼氣原料中畜禽糞便須占80%以上，方可享受此項優(yōu)惠。
 

　　雖然，稻殼、花生殼、玉米芯、油茶殼、棉籽殼等與秸稈同屬農(nóng)業(yè)下腳料，按常理而論，秸稈作為原料也可以列入財稅〔2011〕115號文件第三條第（二）項，從而企業(yè)計入原料比重百分比。但在國家稅務(wù)總局沒有對此條款補充完善前，應(yīng)嚴格按現(xiàn)行規(guī)定執(zhí)行。