在長期待攤費用方面，條例中無論是在定性規(guī)定還是定量規(guī)定上都適當放松了限制。在第六十八條中，將企業(yè)所得稅法第十三條第(一)項和第(二)項所稱固定資產的改建支出，明確為“是指改變房屋或者建筑物結構、延長使用年限等發(fā)生的支出”。那么，企業(yè)對折舊期屆滿或經營租入固定資產進行簡易維護、粉刷之類而發(fā)生的費用便不再強求長期攤銷。在第六十九條中，將企業(yè)必須長期待攤的固定資產大修理支出，明確應“同時”符合兩個條件，其中第一個條件為修理支出應達到取得固定資產時的計稅基礎50%以上，而國稅發(fā)[2000]84號文中規(guī)定的比例為20%，且在若干條件中只要符合條件之一即須長期待攤。不過，如果企業(yè)尚未折舊期滿的固定資產進行改建而發(fā)生的支出，應該按條例第五十八條(六)項的規(guī)定增加固定資產計稅基礎。條例第七十條規(guī)定：企業(yè)所得稅法第十三條第(四)項所稱其他應當作為長期待攤費用的支出，自支出發(fā)生月份的次月起分期攤銷，攤銷年限不得低于3年。此類費用一般是指開辦費等，原稅法規(guī)定要求分5年攤銷，且攤銷起點為“開始生產、經營的次月起”。
　　關于生物資產，應注意的是普通企業(yè)的綠化費不屬于生產性生物資產，不應資本化并加以折舊。
　　7、企業(yè)之間的管理費及企業(yè)內部費用結算等。條例第四十九條規(guī)定：“企業(yè)之間支付的管理費、企業(yè)內營業(yè)機構之間支付的租金和特許權使用費，以及非銀行企業(yè)內營業(yè)機構之間支付的利息，不得扣除”。這一規(guī)定終止了原內資企業(yè)經稅務機關批準可向集團內總公司上交管理費的政策，今后，企業(yè)之間如果確實相互提供勞務、共享資源的，應按獨立企業(yè)的交易原則結算價款。這一規(guī)定也改變了原稅法中外商投資企業(yè)總機構可向分支機構分解費用方面的規(guī)定。
　　8、捐贈支出。新法及條例中對公益性捐贈的定性、扣除比例、限額計算基數、公益性社會團體特征、受贈國家機關的級次等都作了統(tǒng)一。在實務中，應注意稅務機關要求使用捐贈專用收據的問題。
　　三、稅基式、稅率式、稅額式優(yōu)惠：主次分明而又目標一致
　　新法中突出了對特定產業(yè)和項目給予稅收優(yōu)惠的政策導向，逐步弱化地區(qū)優(yōu)惠，統(tǒng)一了內外資企業(yè)的稅收優(yōu)惠，條例在此方面又作了諸多具體規(guī)定。納稅人在適用新稅收優(yōu)惠政策時應注意如下幾點：
　　1、新法及條例規(guī)定的稅率優(yōu)惠是針對納稅人的，能否享受這些優(yōu)惠稅率，企業(yè)應進行身份認定，“對號入座”。如符合條件的國家需要重點扶持的高新技術企業(yè)適用15%的稅率;符合條件的小型微利企業(yè)適用20%的稅率;而非居民企業(yè)在中國境內未設立機構、場所的，或者雖設立機構、場所但取得的所得與其所設機構、場所沒有實際聯(lián)系的，可就其來源于中國境內的所得按10%的優(yōu)惠稅率繳納企業(yè)所得稅。只要符合規(guī)定條件，“企業(yè)”便是優(yōu)惠的對象，整個企業(yè)的相應所得都按優(yōu)惠稅率計稅。