因此，該自然人以非專利技術使用權投資入股，向A公司提供專有技術并取得A公司股權，屬于提供非專利技術使用權取得其他形式的經(jīng)濟利益（A公司股權），自然人應按“特許權使用費所得”繳納個人所得稅。

　　3、定價問題

　　《財政部、工商總局關于加強以非貨幣財產(chǎn)出資的評估管理若干問題的通知》（財企[2009]46號）第一條規(guī)定，有下列情形之一的，應當進行資產(chǎn)評估：

　?。ㄒ唬┩顿Y人以非貨幣財產(chǎn)出資的；

　?。ǘ┰隍炠Y或申請工商登記時，驗資機構或投資人發(fā)現(xiàn)用作出資的非貨幣財產(chǎn)與評估基準日時的資產(chǎn)狀態(tài)、使用方式、市場環(huán)境等方面發(fā)生顯著變化，或者由于評估假設已發(fā)生重大變化，可能導致資產(chǎn)價值發(fā)生重大變化的；

　?。ㄈ┓?、行政法規(guī)規(guī)定的其他需要進行資產(chǎn)評估的事項。

　　第二條規(guī)定，以非貨幣財產(chǎn)出資評估，投資人應當委托依法設立的資產(chǎn)評估機構進行。

　　第三條規(guī)定，以非貨幣財產(chǎn)出資的投資人，應當對所提供的非貨幣財產(chǎn)的真實性、合法性承擔責任。

　　第四條規(guī)定，資產(chǎn)評估機構從事以非貨幣財產(chǎn)出資評估業(yè)務時，應當嚴格遵循有關的資產(chǎn)評估準則和規(guī)范，并對評估結論的合理性承擔法律責任。

　　根據(jù)上述規(guī)定，投資人以非貨幣財產(chǎn)出資的，應當對所提供的非貨幣財產(chǎn)的真實性、合法性承擔責任，資產(chǎn)評估機構對評估結論的合理性承擔法律責任。

　　該專有技術評估價為4000萬元，該自然人與A公司及其原股東不存在關聯(lián)關系，且股東認可，則其定價是合理的。

　　如果該專有技術投資屬于不需開具發(fā)票情形，同時按獨立交易原則定價，并且該專有技術與該公司的生產(chǎn)經(jīng)營有關，其攤銷準予稅前扣除。