內(nèi)部審計的內(nèi)容是一個不斷發(fā)展變化的范疇。現(xiàn)代內(nèi)部審計的內(nèi)容主要可分為以財務活動為對象的內(nèi)部財務審計和以經(jīng)營管理活動為對象的經(jīng)濟效益審計兩大類。但在具體實施審計時，二者又是互相聯(lián)系、交叉、滲透的。內(nèi)部審計人員正是通過對這兩部分內(nèi)容的聯(lián)系審計來促進審計工作目標的實現(xiàn)的。一般地，內(nèi)部審計工作的內(nèi)容包括以下幾部分。　

    一、財政財務收支審計

　　同外部審計相比，內(nèi)部審計實施的財政財務收支審計僅限于對本部門、本單位及所屬各部門、各單位財政財務收支進行的真實、合法和效益審計。由于各部門、各單位的資金來源狀況及資產(chǎn)、負債管理情況不盡相同，內(nèi)部審計的重點也各不相同。對有國家財政資金介入的部門、單位，不僅要審查其自身財務狀況，還須重點檢查財政資金的使用渠道和使用方向。

　　1.行政單位的內(nèi)部財政財務收支審計，重點是各級國家權(quán)力機關、行政機關、審判機關、檢察機關、各黨派、社會團體及其在境外的派出機構(gòu)的行政經(jīng)費、罰沒收入和行政性收費的真實、合法和效益性。

　　2.事業(yè)單位的內(nèi)部財政財務收支審計，重點是各項事業(yè)經(jīng)費收支的真實、合法和效益性，包括用于科學、教育、文化、衛(wèi)生、廣播影視、地震、體育、民政、外交及農(nóng)業(yè)、工業(yè)、交通、郵電通訊、商業(yè)貿(mào)易、工商行政、商品檢驗等各項事業(yè)發(fā)展的經(jīng)費。這里，既包括財政預算撥款的審查，也包括財政預算外安排的各項資金、事業(yè)周轉(zhuǎn)金和事業(yè)性收費的審查。

　　3.企業(yè)單位(包括金融企業(yè))的內(nèi)部財政財務收支審計，重點是其資產(chǎn)、負債和損益的真實、合法和效益性。審查的主要內(nèi)容：企業(yè)制定的各項制度是否符合國家有關法律法規(guī)的要求；企業(yè)一定時期內(nèi)擁有的資產(chǎn)、承擔的債務、經(jīng)營成果及其分配情況的真實、合法性；企業(yè)占有的國有資產(chǎn)的安全、完整和保值增值情況。

　二、經(jīng)濟效益審計

　　財政財務收支審計是內(nèi)部審計的基礎，經(jīng)濟效益審計則是內(nèi)部審計發(fā)展到現(xiàn)階段的特殊內(nèi)容。而且，隨著市場經(jīng)濟競爭的加劇，質(zhì)量和效益已成為每個企業(yè)發(fā)展的直接決定力；通過內(nèi)部審計找出經(jīng)營管理中存在的問題，提出改進措施，以提高經(jīng)濟效益，也成為企業(yè)管理者設置內(nèi)部審計機構(gòu)和人員的主要目的。內(nèi)部審計人員在財務收支審計的基礎上進行效益審計，有許多方便之處：一是熟悉本單位情況，可以有針對性地做深入細致的調(diào)查工作；二是有足夠的時間深入生產(chǎn)經(jīng)營的各個環(huán)節(jié)，及時取得有關資料和信息；三是內(nèi)部審計的相對獨立地位，有利于提供客觀、真實、可靠的信息，更好地為改善本部門或本單位的經(jīng)營管理、提高經(jīng)濟效益服務。