基本案情：

隨著《國家稅務總局關于房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)土地增值稅清算管理有關問題的通知》的發(fā)布，2007年1月某市地稅稽查局接到群眾舉報：某房地產(chǎn)開發(fā)公司于2005年12月10日將位于繁華地段的一幢2000平方米待售的辦公大樓以每平方米2000 元的價格對外銷售，獲得銷售收入4000 萬元。企業(yè)只按5%申報繳納營業(yè)稅200萬元，城市維護建設稅14 萬元，教育費附加6萬元，印花稅2萬元。舉報者認為該房地產(chǎn)開發(fā)公司未交土地增值稅，偷稅300多萬元，要求對該公司進行檢查。

案件處理：

接到群眾舉報后，稽查局按照規(guī)定程序經(jīng)過檢查核實，公司為建造這幢辦公大樓支付地價款800萬元，房地產(chǎn)開發(fā)成本1200萬元，房地產(chǎn)開發(fā)費用由于未對具體樓盤進行明細核算，難以劃分?；榫职匆?guī)定程序查補了土地增值稅，并處以一倍的罰款，處理如下：扣除項目：（800+1200）×[1+（10%+20%）]+220=2820（萬元）增值額：4000 -2820 =1180（萬元）增值額與扣除項目額比例：（1180÷2820）×100%=41.84%應交土地增值稅稅額：1180×30%=354（萬元）同時，按規(guī)定加收了滯納金。罰款一倍，計354萬元，并移送公安部門追究相應的法律責任。

法理分析：

根據(jù)《中華人民共和國土地增值稅暫行條例》第六條的規(guī)定，計算增值額的扣除項目：（一）取得土地使用權所支付的金額；（二）開發(fā)土地的成本、費用；（三）新建房及配套設施的成本、費用，或者舊房建筑物的評估價格；（四）與轉讓房地產(chǎn)有關的稅金；（五）財政部規(guī)定的其他扣除項目。

《中華人民共和國土地增值稅暫行條例實施細則》第七條第（三）項規(guī)定，開發(fā)土地和新建房及配套設施的費用（以下簡稱房地產(chǎn)開發(fā)費用），是指與房地產(chǎn)開發(fā)項目有關的銷售費用、管理費用、財務費用。財務費用中的利息支出，凡能夠按轉讓房地產(chǎn)項目計算分攤并提供金融機構證明的，允許據(jù)實扣除，但最高不能超過按商業(yè)銀行同類同期貸款利率計算的金額。其他房地產(chǎn)開發(fā)費用，按本條（一）、（二）項規(guī)定計算的金額之和的百分之五以內計算扣除。凡不能按轉讓房地產(chǎn)項目計算分攤利息支出或不能提供金融機構證明的，房地產(chǎn)開發(fā)費用按本條（一）、（二）項規(guī)定計算的金額之和的10%以內計算扣除。

第七條第（六）項又規(guī)定，根據(jù)條例第六條第（五）項規(guī)定，對從事房地產(chǎn)開發(fā)的納稅人可按本條（一）、（二）項規(guī)定計算的金額之和，加計20%的扣除?！吨腥A人民共和國土地增值稅暫行條例》第四條規(guī)定，納稅人轉讓房地產(chǎn)所取得的收入減除本條例第六條規(guī)定扣除項目金額后的余額，為增值額?！吨腥A人民共和國土地增值稅暫行條例實施細則》第十條第一項規(guī)定，增值額未超過扣除項目金額50%，土地增值稅稅額=增值額×30%.《財政部、國家稅務總局關于土地增值稅一些具體問題規(guī)定的通知》（財稅字咱1995暫048號）第九條關于計算增值額時扣除已繳納印花稅的問題的規(guī)定，細則中規(guī)定允許扣除的印花稅，是指在轉讓房地產(chǎn)時繳納的印花稅。房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)按照《施工、房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)財務制度》的有關規(guī)定，其繳納的印花稅列入管理費用，已相應予以扣除。其他的土地增值稅納稅義務人在計算土地增值稅時允許扣除在轉讓時繳納的印花稅。