5.對(duì)公共配套設(shè)施費(fèi)的處理，二者有區(qū)別。企業(yè)所得稅中，該項(xiàng)費(fèi)用是指開發(fā)項(xiàng)目?jī)?nèi)發(fā)生的、獨(dú)立的、非營(yíng)利性的，且產(chǎn)權(quán)屬于全體業(yè)主的，或無償贈(zèng)與地方政府、政府公用事業(yè)單位的公共配套設(shè)施支出。在土地增值稅中，還包括不能有償轉(zhuǎn)讓的開發(fā)小區(qū)內(nèi)公共配套設(shè)施發(fā)生的支出。二者的區(qū)別是，企業(yè)所得稅對(duì)此有限制條件，即必須是“獨(dú)立的、非營(yíng)利性的，且產(chǎn)權(quán)屬于全體業(yè)主的，或無償贈(zèng)與”的公共配套設(shè)施費(fèi)，而對(duì)于“營(yíng)利性的，或產(chǎn)權(quán)歸企業(yè)所有的，或未明確產(chǎn)權(quán)歸屬的，或無償贈(zèng)與地方政府、公用事業(yè)單位以外其他單位的”，則應(yīng)單獨(dú)核算其成本。除企業(yè)自用應(yīng)按固定資產(chǎn)進(jìn)行處理外，其余一律按開發(fā)產(chǎn)品進(jìn)行處理。

　　土地增值稅對(duì)上述規(guī)定作了補(bǔ)充，國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)土地增值稅清算管理有關(guān)問題的通知》（ 國(guó) 稅 發(fā) [ 2 0 0 6 ] 1 8 7 號(hào) ）規(guī)定，房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)開發(fā)建造的與清算項(xiàng)目配套的公共設(shè)施，按以下原則處理：建成后產(chǎn)權(quán)屬于全體業(yè)主所有的，其成本、費(fèi)用可以扣除；建成后無償移交給政府、公用事業(yè)單位用于非營(yíng)利性社會(huì)公共事業(yè)的，其成本、費(fèi)用可以扣除；建成后有償轉(zhuǎn)讓的，應(yīng)計(jì)算收入，并準(zhǔn)予扣除成本、費(fèi)用。

　　6.對(duì)開發(fā)間接費(fèi)的處理，二者有區(qū)別。企業(yè)所得稅中，該項(xiàng)費(fèi)用是指企業(yè)為直接組織和管理開發(fā)項(xiàng)目所發(fā)生的，且不能將其歸屬于特定成本對(duì)象的成本費(fèi)用性支出，主要包括管理人員工資、職工福利費(fèi)、折舊費(fèi)、修理費(fèi)、辦公費(fèi)、水電費(fèi)、勞動(dòng)保護(hù)費(fèi)、工程管理費(fèi)、周轉(zhuǎn)房攤銷以及項(xiàng)目營(yíng)銷設(shè)施建造費(fèi)等。和土地增值稅中的開發(fā)間接費(fèi)用相比，前者比后者多了工程管理費(fèi)和營(yíng)銷設(shè)施建造費(fèi)。稅法規(guī)定，工程管理費(fèi)符合土地增值稅間接費(fèi)用范圍，可以作為扣除項(xiàng)目。而營(yíng)銷設(shè)施建造費(fèi)能否作為扣除項(xiàng)目，需要稅務(wù)機(jī)關(guān)進(jìn)一步明確。

　　7.預(yù)提費(fèi)用和利息費(fèi)用的處理，二者有區(qū)別。 國(guó) 稅 發(fā) [ 2 0 0 9 ] 3 1 號(hào) 文件第三十二條規(guī)定，出包工程未最終辦理結(jié)算而未取得全額發(fā)票的，在證明資料充分的前提下，其發(fā)票不足金額可以預(yù)提，但最高不得超過合同總金額的10%.公共配套設(shè)施尚未建造或尚未完工的，可按預(yù)算造價(jià)合理預(yù)提建造費(fèi)用。應(yīng)向政府上交但尚未上交的報(bào)批報(bào)建費(fèi)用、物業(yè)完善費(fèi)用可以按規(guī)定預(yù)提。第二十一條規(guī)定，企業(yè)為建造開發(fā)產(chǎn)品借入資金而發(fā)生的符合稅收規(guī)定的借款費(fèi)用，可按企業(yè)會(huì)計(jì)準(zhǔn)則的規(guī)定進(jìn)行歸集和分配，其中屬于財(cái)務(wù)費(fèi)用性質(zhì)的借款費(fèi)用，可直接在稅前扣除。

　　在土地增值稅清算中，稅法規(guī)定預(yù)提費(fèi)用不得稅前扣除，利息費(fèi)用要單獨(dú)計(jì)算扣除，不能重復(fù)計(jì)入開發(fā)成本中。 國(guó) 稅 發(fā) [ 2 0 0 6 ] 1 8 7 號(hào) 文件規(guī)定，房地產(chǎn)開發(fā)企業(yè)的預(yù)提費(fèi)用，除另有規(guī)定外，不得扣除。國(guó)家稅務(wù)總局《關(guān)于印發(fā)<土地增值稅清算管理規(guī)程>的通知》（ 國(guó) 稅 發(fā) [ 2 0 0 9 ] 9 1 號(hào) ）第二十七條要求，在審核利息支出時(shí)應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注納稅人是否將利息支出從房地產(chǎn)開發(fā)成本調(diào)整至開發(fā)費(fèi)用。